The Apothecary Diaries सीज़न 3 का एपिसोड 54, "Kami no Mura" (紙の村, मोटे तौर पर "कागज़ का गांव"), 6 नवंबर 2026 को जापान में प्रसारित हुआ। Anime Anime के एपिसोड रीकैप के अनुसार, इस एपिसोड में Maomao और भेस बदले हुए Jinshi क्वैक डॉक्टर के गृहनगर की यात्रा करते हैं।
आगे एपिसोड 54 के स्पॉइलर हैं।
दो बच्चे गाना गाते हुए घर लौटते हैं, और उनमें से एक के हाथ में वुल्फ़्सबेन से भरी टोकरी है। उनके साथ आया आदमी एक नज़र में ही इस ज़हरीले पौधे और मगवर्ट का फ़र्क पहचान लेता है, और यह भी जानता है कि इसकी जड़ को हर्बल दवा के रूप में इस्तेमाल किया जा सकता है। एक छोटे से टेस्ट से पता चलता है कि उसे औषधीय जड़ी-बूटियों की जानकारी है और वह कुछ हद तक पढ़ भी सकता है। इसके बाद Maomao उसे ट्रेनिंग देना शुरू करती है, ताकि ज़रूरत पड़ने पर वह उसकी जगह काम संभाल सके। Anime Anime के मुताबिक, दर्शकों ने उसके बारे में "हद से ज़्यादा काबिल" (अनूदित) जैसे कमेंट पोस्ट किए।
बाद में क्वैक डॉक्टर अपने पैतृक गांव के लिए रवाना होता है। Jinshi एक सेवक के भेस में इस दल के साथ जाता है, और इसके लिए उसने जानबूझकर अपने चेहरे पर एक घाव भी लगा लिया है। सिर्फ़ क्वैक डॉक्टर ही इस भेस को नहीं पहचान पाता। रीकैप के अनुसार, Jinshi के इस नए लुक पर फ़ैन्स के उत्साह भरे पोस्ट्स की झड़ी लग गई।
करीब दो दिन के बग्घी के सफ़र के बाद दल वहां पहुंचता है। डॉक्टर की बहन कहती है कि उसे लगा था उसका ख़्वाजासरा (eunuch) भाई घर एक युवा दुल्हन ले आया है — यह सुनकर हड़बड़ाए Jinshi के हाथ से चाय का कप गिर जाता है। बहन के पति डॉक्टर की तारीफ़ एक महान चिकित्सक के रूप में करते हैं, जिसने सम्राट के बच्चे का जन्म करवाया था। इससे पता चलता है कि डॉक्टर घरवालों के सामने अपनी उपलब्धियों को बढ़ा-चढ़ाकर बताता रहा है। पति एक नए ज़मींदार के साथ ज़मीन के अधिकारों को लेकर चल रहे विवाद के बारे में भी बताते हैं, जिसकी एक वजह टिड्डियों से निपटने के उपायों के लिए अनाज कर में की गई बढ़ोतरी भी है। Maomao और बाकी लोग अगले दिन ज़मींदार के साथ होने वाली बातचीत में शामिल होंगे। एपिसोड के अंत में परिवार का शत्रुतापूर्ण रवैये वाला बड़ा बेटा एक खलिहान में रोती हुई एक युवती को थामे हुए नज़र आता है, और वादा करता है कि वह सब ठीक कर देगा।
एपिसोड 55, "Kake" (賭け, मोटे तौर पर "दांव"), 13 नवंबर को प्रसारित होने वाला है। सीज़न 3 जापान में 30 Nippon TV-संबद्ध स्टेशनों पर FRIDAY ANIME NIGHT ब्लॉक में हर शुक्रवार रात 23:00 JST पर प्रसारित होता है, और ABEMA इसे हर शुक्रवार 24:00 JST से मुफ़्त स्ट्रीम करता है। सीज़न का दूसरा कोर (cour) अप्रैल 2027 में आएगा।